Progenesis QI for Proteomics 버전 3 MSe 프로세싱 중단 - WKB55784

증상

• Progenesis QI for Proteomics version 3에서 MSe, HD-MSe 또는 SONAR 데이터 프로세싱이 중단됨
• 컴퓨터의 모든 RAM이 사용되고 있으므로 컴퓨터가 일반적으로 느리고 응답하지 않습니다.
• Windows Task Manager를 열고 Process(프로세스) 탭으로 이동하여 RAM 사용량별로 정렬합니다. peptide3D.exe라는 프로세스는 사용 가능한 거의 모든 RAM을 사용하고 있습니다.

환경

• Progenesis QI for Proteomics version 3

참고 - 이는 버전 3에만 해당됩니다. 버전 4 이상에서 수정되었습니다.

원인

MSe 프로세싱 중에 peptide3D.exe가 사용하는 기본 저에너지 대 고에너지 피크 매칭 설정은 peptide3D가 많은 RAM을 필요로 함을 의미합니다. 특히 올바르게 최적화되지 않아 Apex3D 문턱값이 너무 낮은 경우에 그렇습니다. 결과적으로 64GB RAM이 장착된 PC도 일부 데이터 세트에서 어려움을 겪을 수 있습니다. 이러한 설정은 Progenesis QI for Proteomics 내에서 구성할 수 없지만 명령 파일을 사용하여 수정할 수 있습니다.

수정 또는 해결 방법

1. 첨부 파일 peptide3D_params.txt를 C:\Program Files (x86)\ Nonlinear Dynamics\ Progenesis QI for proteomics\Plugins\WatersRawFolderReader\Processing\에 저장합니다.
2. 프로세싱 중인 데이터에 대해 Apex3D 문턱값을 최적화하고(WKB1232 참조) 데이터를 다시 프로세스합니다.PLGS Threshold Inspector를 사용하여 MSe 스펙트럼 프로세스 파라미터를 최적화함 - WKB1232

추가 정보