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Tof MRM 실험을 설정하는 방법 - WKB5226

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Article number: 5226To English version

목적 또는 목표

Tof MRM Method 생성

환경

  • Xevo G2-XS
  • Synapt G2-S
  • Synapt G2-Si

절차

  1. Tof-MRM 실험을 설정하려면 MS Method Editor 창에서 Tof-MRM 수집 타입을 선택해야 합니다.
  2. Acquisition 탭에서 시간 길이, 소스 타입, 극성 및 Tof 모드를 비롯한 기본 Method 매개 변수를 지정합니다.

Tof_MRM_Acqn.PNG

  1. Tof MS 탭에서 질량 범위, 스캔 시간 및 데이터 형식을 포함하여 Tof 분석기에 대한 매개 변수를 입력합니다. 질량 범위는 모든 관심 질량을 포함하여야 합니다. 이는 특히 MRM 창에 RADAR 또는 None을 사용하는 경우에 적용됩니다(5단계 참조).

Tof_MRM_TofMS.PNG

  1. MRM 탭에는 수행할 MRM 실험과 관련된 매개 변수가 포함되어 있습니다. MRM은 시작 및 종료 시간, 전구체 및 조각 이온의 질량, 충돌 에너지, 콘 전압 및 Target Enhancement 질량(사용하는 경우 daughter 이온 질량으로 설정해야 함)을 수동으로 입력하여 예약할 수 있습니다. MRM 일정은 이전 실험실 또는 엑셀 스프레드 시트에서 직접 * .mrm 파일로 가져올 수도 있습니다. MRM 탭의 다른 옵션에는 RADAR 전환, 스캔 패딩 및 데이터 스트리핑(필요할 경우)이 있습니다(아래 설명 참조).

Tof_MRM_MRM.PNG

Radar - 원할 경우 실험의 주 초점 인 MRM 전이 외부에 추가로 샘플에 존재하는 기타 데이터를 제공하기 위해 전체 Tof MS 스펙트럼 스캔을 예약할 수 있습니다.

Scan Padding - 여러 개의 MRM이 중복 실행될 경우 실행 동시 MRM 수가 변경되므로 스캔 패딩을 활성화하는 것이 가장 좋습니다. 이 기능은 연속적인 MRM 수가 삭제되는 영역에 dummy 함수를 삽입하므로, 실험 기간 동안 주어진 전환을 찾는 데 소요 된 시간이 일정하게 유지됩니다. 정확한 정량에는이 설정이 필요합니다.

Data Stripping - 기본적으로, MassLynx는 Tof MS 탭에 지정된 전체 수집 질량 범위를 커버하는 데이터를 저장합니다. 이것은 MRM 창의 없음 옵션입니다. 이 옵션은 권장되지 않습니다. 보기 쉽고 파일의 크기를 크게 줄이기 위해 데이터 스트리핑을 사용하여 디스크에 기록 된 Tof MS 데이터를 제한 할 수 있습니다. 동위 원소 클러스터 옵션은 단일 조각 옵션이 타겟 조각 이온 질량을 중심으로 -0.2 ~ + 0.2Da 창 안의 데이터를 유지하는 동안, 목표 단편 이온 질량 주위로 -1 ~ + 5Da의 창 내에 데이터를 유지합니다.

  1. Method에 MRM 전이를 추가하려면 Add를 선택하여 MRM 편집기를 엽니다. 원하는 경우 화합물 이름을 입력합니다. 머무름 시간 범위를 입력하고 Set Mass에 parent 질량을 질량 설정에서 입력합니다. Fragments에 하나 이상의 조각 이온 질량을 입력할 수 있습니다. Trap(또는 Transfer) CE 램프 창에서 낮은 충돌 에너지 및 높은 충돌 에너지를 입력하여 충돌 에너지 램프를 설정합니다. 충돌 에너지 램프가 필요하지 않은 경우, 두 창에 동일한 충돌 에너지를 입력합니다. 펩타이드에 대한 좋은 램프는 10 ~ 45입니다. 원하는 콘 전압을 입력합니다. Target Enhancement m/z의 경우 주 자식 이온의 m/z를 입력합니다. MRM 전이에 만족하면 Add를 선택한 다음 Save를 선택하여 * .mrm 파일을 저장합니다. 이렇게 하면 MRM 전이 MS Method가 아니라 파일로 저장됩니다. 모든 MRM 전이 * .rmrm 파일에 저장되면 Tof MRM MS Method (* .exp)를 저장합니다.

Tof_MRM_MRM_editing.PNG

  1. Method를 저장하기 전에 트랜지션을 정렬해야 합니다.

 

추가 정보

MS Method는 최소한의 함수만 생성되도록 함수를 재사용합니다. 이 Method에는 10 번의 MRM 전이가 있을 수 있지만, 세 가지 기능만 있을 수 있습니다. 각 전환이 수집된 기능을 보려면 데이터 file.raw 폴더로 이동하여 메모장 또는 Excel에서 * .fdc 파일을 엽니다. 함수와 각 전환의 목록이 표시됩니다.

.fdc 파일을 Excel로 열려면 다음과 같이 하십시오. Excel을 열고 File open을 선택한 다음 파일로 이동하십시오. *. *를 파일 형식으로 선택하고 구분 기호를 선택하고 Next을 선택한 다음 다른 기호를 제외한 모든 구분 기호를 선택합니다.

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