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Deconvoluted 조각의 스펙트럼은 Review의 Fragmentation Viewer와 어떻게 다릅니까? - WKB99805

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환경

  • UNIFI
  • 펩타이드 맵핑

답변

Fragmentation Viewer의 스펙트럼은 다음 단계에서 표시됩니다.

먼저, Function1의 (충돌 전압) 낮은 에너지 데이터와 Function2의 (충돌 전압) 높은 에너지 데이터를 별도로 사용하여 피크 검출이 수행됩니다.

m/z 축, 머무름 시간 축 및 강도의 3차원 데이터에서, 3차원 산 모양의 피크가 검출되면, 피크로 검출됩니다.

이동상 불순물과 같이 시간이 지남에 따라 검출된 피크는 피크로 인식되지 않습니다.

피크를 검출할 수 있는 최소 강도에 대한 분석 방법의 다음 설정은 문턱값입니다.

Processing 탭 > Find 3D peaks > (High Energy/Low Energy) Intensity Threshold

스펙트럼이 Investigate 화면에서 적분된 경우 시간에 따라 검출된 피크 또는 위에서 설명한 강도가 낮은 피크도 적분됩니다.

 


다음으로, 동일한 머무름 시간을 가진 precursor 이온 피크(Function1)와 Product 이온 피크(Function2)가 연결되고 MaxEnt3으로 디콘볼루션이 수행됩니다.
여기에서 다음 분석법 설정이 사용됩니다.

Processing tab > 3D Isotope Clustering > Fraction of the chromatographic peak width를 클릭하여 클러스터 생성 및 고/저 에너지 연결 도중 적용합니다.

이는 동위원소 이온의 스펙트럼 피크를 수집할 때 허용되는 머무름 시간 차이 및 Precursor 이온과 Product 이온을 연결할 때의 허용 가능한 머무름 시간 차이를 설정합니다.

크로마토그램 피크의 절반 너비에 대한 분획으로 설정합니다.

 

Processing tab > 3D Isotope Clustering > Fraction of the chromatographic peak width를 클릭하여 클러스터 생성 및 고/저 에너지 연결 도중 적용합니다.
Precursor 이온과 Product 이온을 연결할 때 적용될 피크 강도 문턱값을 설정합니다.

조각 이온의 스펙트럼이 Investigate 화면에서 적분된 경우, 이 스펙트럼은 유사한 머무름 시간을 가진 Precursor 이온에서 파생된 조각화 이온을 포함하는 혼합물을 의미합니다.

낮은 강도의 피크도 모두 볼 수 있습니다.

추가 정보

 

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