MSe 또는 HD-MSe 데이터를 PLGS 또는 Progenesis QIp에서 분석하기 위해 MassLynx RAW 파일로 내보낼 수 있습니까? - WKB44745

환경

• UNIFI 1.9 SR3
• UNIFI 1.9 SR4

• MassLynx

• ProteinLynx Global Server (PLGS)

• Progenesis QI for Proteomics

• Vion IMS QToF

• Xevo G2-XS QToF

답변

UNIFI 제어하의 Xevo G2-XS QToF 또는 Vion IMS-QToF중 그 어느 것도 MassLynx (.raw), Mascot Generic Format (MGF) 등의 다른 파일 형식으로 데이터를 내보내거나 mzML과 같은 표준 파일 형식을 열 경우에도 Proteomics 워크플로우를 지원하지 않습니다.

추가 정보

UNIFI는 Oracle 데이터베이스가 사용할 수 없을 정도로 커지지 않도록 지정된 수집의 피크 수를 제한합니다. MSe proteomics 수집은 일반적으로 수백만 개의 피크가 포함된 데이터 파일을 생성하기 때문에 UNIFI는 Vion 또는 XevoG2-XS의 proteomics 데이터의 수집을 지원하지 않습니다. Proteomics 데이터를 수집하는 경우, .raw 형식으로 내보낸 후 필요한 피크가 모두 표시되지 않는데 즉 데이터가 잘리게 됩니다. 내보낸 파일에 피크가 모두 포함되지 않으며 PLGS, Progenesis QIp 또는 Mascot의 데이터 분석이 완전히 실패하거나 부분 결과만 생성됩니다.