UNIFI에서 성분을 수동으로 할당하는 방법 - WKB13608

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답변

성분을 수동으로 할당하는 옵션은 관심 피크에 대한 "Alternate assignments" 결정에 따라 달라집니다.

 

"Alternate assignments" 필드는 식별 알고리즘이 실행된 후 소프트웨어에 의해 자동으로 채워집니다.

"Yes"는 주어진 m/z 값을 가진 피크의 경우 소프트웨어가 둘 이상의 변형 단백질을 가능한 일치 항목으로 식별했음을 의미합니다(가능한 일치 항목 수는 분석 Method에 설정된 질량 허용 오차의 영향을 받습니다. 질량 허용 범위를 더 크게 설정할수록 더 많은 일치 항목을 얻을 수 있음).

가능한 일치 항목이 여러 개 발견되면 "best match" 알고리즘은 최고 매칭률을 가진 성분을 결정하는데, 이 성분은 피크 질량에 할당된 성분이 되고 다른 가능한 매칭 성분은 대안이 됩니다.

"Alternate assignments"가 "Yes"로 설정된 성분이 있고 "perform manual assignment" 버튼(화면 왼쪽의 성분 테이블과 성분 요약 테이블 모두에 있음)을 누르면 나타나는 대화 상자에는 소프트웨어가 찾아낸 모든 가능한 대안 성분이 표시됩니다. 사용자는 수동 할당이 필요한지 여부를 결정할 수 있습니다.

• 소프트웨어에 의해 식별된 가장 적합한 성분을 기타 대안 성분으로 교체합니다.
• 성분 세부 정보를 편집합니다 .
• Remove - 이 옵션은 가장 적합하다고 할당된 성분을 제거하고 해당 피크 질량을 후보 성분으로 변경합니다.

"No"는 소프트웨어가 피크에 대해 하나의 가능한 일치 항목만 발견했음을 의미합니다.

"Alternate assignments"가 "No"로 설정된 성분이 있고 "perform manual assignment" 버튼을 누르면 다음 중 하나를 수행할 수 있습니다.

• Edit - 성분 세부 정보를 편집합니다.
• Remove - 이 옵션은 가장 적합하다고 할당된 성분을 제거하고 해당 피크 질량을 후보 성분으로 변경합니다.

두 가지 수동 할당의 차이점을 명확히 하기 위해 다음에 대해 논의합니다.

성분 테이블 도구 모음의 "Perform manual assignment"는 피크 질량에 할당된 성분을 변경합니다 (주어진 m/z에 할당될 수 있는 대안 성분을 찾음).

참고: 성분 요약 테이블 도구 모음의 "View Alternative Assignment"는 동일한 작업을 수행합니다. 하지만 일관적이지 않습니다. 3.gif를 참조하십시오.

크로마토그램의 상황에 맞는 메뉴의 Tool(도구) 옵션에서 "Manual assign component"는 지정된 머무름 시간이 할당된 성분을 변경하는 것입니다.

예를 들어, 다음과 같이 가정합니다.

RT이 1분인 피크를 가진 TIC 크로마토그램과 RT이 1.1분인 피크를 가진 TUV 크로마토그램이 있습니다(오프셋이 적절하게 설정됨).

TIC 피크에 아래 두 개의 질량 피크가 존재합니다. m/z 1, 반응 1000 및 observedRT 1분 및 m/z 2, 반응 500 및 observedRT 1분.

두 질량 피크에 대한 식별을 실행할 때 소프트웨어는 다음과 같이 결정합니다.

• m/z1: 매칭률이 가장 높은 성분은 A이며 가능한 대안으로 B와 C가 있습니다.
• m/z2: 매칭률이 가장 높은 성분은 D이며 가능한 대안이 없습니다.

m/z 1에 대한 반응이 더 높고 성분 A가 이에 가장 적합하기에 TIC 피크는 A와 관한 것으로 주석이 달립니다. 그런 다음 성분 A가 TUV 피크에 할당됩니다(RT 설정에 의한 표적을 기준으로 함).

성분 테이블 도구 모음에서 "Perform manual assignment"를 수행하고 성분 A를 성분 B로 교체하면 TIC 피크 주석이 변경됩니다. TUV 피크 주석이 제거되고 Tools에서 "Manually assign component"를 선택하면 피크에 성분 B를 할당하는 것으로 선택할 수 있습니다.

수동 할당 마법사의 전체 옵션은 Component 테이블에서만 사용할 수 있으며, Review 창의 왼쪽 상단에 있는 워크플로우 아이콘을 클릭한 다음 "Injection and Components"를 선택하여 액세스할 수 있습니다. 크로마토그램을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하여 마법사에 액세스할 수도 있지만 이 경우 옵션이 줄어들고 전체 샘플에 적용되지 않을 수 있습니다.

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