스펙트럼 창의 헤더에서 MSMS Set Mass가 피크 질량과 일치하지 않는 이유는 무엇입니까? - wkb28313

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환경

답변

MSMS, Tof-MRM MS Method 또는 DDA Method 등의 목록에 포함된 Method를 사용하여 데이터를 수집할 경우, MassLynx 스펙트럼 창에서 데이터를 다시 볼 때 quad Set Mass가 Method에 지정된 질량과 약간 다를 수 있습니다.　

이와 유사하게 DDA 분석에서, 기기가 MS survey 수집에 지정된 대로 특정 Quad 설정 질량을 실행하도록 지시하면, survey 스캔의 질량과 결과 MSMS 스펙트럼 헤더의 질량이 다를 수 있습니다.

MSMS/DDA 전환 실험을 수행할 때, 결과로 생성되는 Raw 파일의 Spectrum 헤더 또는 Spectrum > SpectrumQTOF > SetMass에 기록된 Set Mass가 MS Method 및 피크 주석에 표시된 질량과 다릅니다.

SYNAPT G2-Si의 MSMS 데이터 예시:

Xevo G2-XS QTof의 DDA 데이터 예시

이는 검량이 로드된 것과 관련이 있는 것으로 보입니다. uncal.cal이 로드되면 리드백(readback) 오류가 표시되지 않습니다.

이는 MassLynx가 스펙트럼 헤더에 Set Mass를 보고하는 방식으로 인해 발생합니다. 수집 중에 quad에 의해 적용된 Set Mass는 정확하지만 스펙트럼 헤더에 보고된 질량에서는 검량이 잘못 적용되었습니다. 이 버그는 Waters 소프트웨어 개발자에 의해 조사 중입니다만 다른 문제를 일으키지 않고는 수정할 수 있는 방법은 없습니다.

MassLynx 헤더에 기록된 Set Mass는 Quadrupole 전자 기기로 전송된 값으로, 지정된 질량을 제외한 모든 질량이 MSMS 분석을 위한 충돌 셀 및 Time of Flight 검출기로 전달되는 것을 제외할 수 있도록 합니다. 이는 정확한(소수점 4자리까지) 관찰된 상위 이온 질량과 동일하지 않습니다. 이는 부분적으로 MSMS로의 전환을 트리거한 이온이 충돌 셀 및 Time of Flight 검출기로 전달되기 위해 매우 정확할 필요가 없기 때문입니다.

추가 정보

이는 영향을 받는 기기의 데이터에 대한 UNIFI 1.9.4 포스트 프로세싱에도 부정적인 영향을 미칩니다. 문서28317을 참조하십시오.

MassLynx DDA 데이터를 UNIFI 1.9.13이 설치된 waters_connect로 가져올(Import) 때 parent 질량은 헤더 파일에서 읽히는 것이 아니라 데이터로부터 계산됩니다. 따라서 UNIFI 1.9.13은 MassLynx DDA 데이터에서 이 문제의 영향을 받지 않습니다.